A endometriose pode se desenvolver em qualquer mulher que menstrue, especialmente naquelas que nunca tiveram filhos, ou quando existe história da doença na família. Em 40% das vezes a mulher pode não apresentar queixas, mas um sinal importante que deve ser valorizado é a ocorrência de cólicas menstruais intensas, especialmente em mulheres que nunca as apresentaram anteriormente. As cólicas geralmente são de difícil controle, mesmo utilizando-se analgésicos potentes, e vão tornando-se progressivamente mais intensas.
Nesses casos, um ginecologista deve ser procurado para investigar a causa dessas cólicas menstruais, que em algumas situações pode ser a endometriose. Outras vezes a mulher pode apresentar uma dor crônica diária na região do baixo ventre, que piora no período pré-menstrual e durante a menstruação.
Também são comuns as queixas de dor ao evacuar ou durante a relação sexual. Podem ocorrer distúrbios menstruais, tais como aumento do fluxo menstrual ou sangramentos vaginais fora do período da menstruação. A dificuldade de engravidar, por si só, já é um motivo para se desconfiar da endometriose, pois, como foi dito anteriormente, nem sempre a mulher tem queixas, mesmo nos casos mais graves.